Agencija ima službu, koja obavlja stručne i druge poslove za potrebe Agencije.
Službom Agencije rukovodi direktor.
Unutrašnje uređenje i sistematizacija radnih mesta u službi Agencije uređuju se aktom koji donosi direktor, po pribavljenom mišljenju Veća Agencije i uz saglasnost odbora Narodne skupštine nadležnog za poslove državne uprave.