Organ poslovođenja Medicinskog fakulteta Vojnomedicinske akademije je dekan.
Nadležnosti organa poslovođenja iz propisane su opštim aktom vojne visokoškolske ustanove i aktom o unutrašnjoj organizaciji i sistematizaciji radnih mesta.
Organ poslovođenja iz postavlja nadležni starešina na osnovu propisa kojima je regulisana služba profesionalnih vojnih lica u skladu sa aktom o unutrašnjoj organizaciji i sistematizaciji radnih mesta iz reda nastavnika vojne visokoškolske ustanove.
Mandat organa poslovođenja traje tri godine, sa mogućnošću jednog ponovnog imenovanja.