Direktor filijale odgovoran je za zakonitost rada filijale, kao i za zakonito i namensko korišćenje prenetih sredstava za sprovođenje zdravstvenog osiguranja.
Direktor filijale izvršava odluke organa Republičkog fonda.
Direktora filijale na osnovu javnog konkursa imenuje direktor Republičkog fonda na period od četiri godine.
Direktor filijale mora ispunjavati uslove iz .
Direktor filijale u obavljanju poslova vrši javnu funkciju.
Na obavljanje javne funkcije direktora filijale primenjuju se odredbe zakona kojim se uređuje rad Agencije za borbu protiv korupcije.
Direktor filijale po isteku mandata nastavlja da obavlja poslove u skladu sa zakonom i statutom Republičkog fonda do dana imenovanja direktora filijale, po postupku propisanim ovim zakonom.
Dužnost direktora filijale prestaje istekom mandata i razrešenjem.
Direktor Republičkog fonda razrešava direktora filijale pre isteka mandata u sledećim slučajevima: