Zdravstvena delatnost na tercijarnom nivou zdravstvene zaštite u vojnom zdravstvu obuhvata pružanje najsloženijih oblika zdravstvene zaštite i specijalističko- konsultativne i bolničke delatnosti, naučnoistraživačku i obrazovnu delatnost, u skladu sa zakonom kojim se uređuje naučnoistraživačka delatnost, odnosno delatnost obrazovanja, kao i apotekarsku delatnost u skladu sa zakonom.