Rukovođenje vojnoškolskim ustanovama ostvaruje se primenom subordinacije, kroz jedinstveno i usklađeno delovanje pri preduzimanju radnji i mera radi ostvarivanja ciljeva vojnog obrazovanja i unapređenja sistema vojnog obrazovanja.

Organizacija i poslovanje zasniva se na opštim aktima vojnoškolskih ustanova i propisima o organizaciji i materijalnom i finansijskom poslovanju vojnih ustanova.